Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifna11Q61716 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna11Q61716 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms