Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A8Q2Y0W8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A8Q2Y0W8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms