Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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