Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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TP53BP1Q12888 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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TP53BP1Q12888 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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TP53BP1Q12888 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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TP53BP1Q12888 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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TP53BP1Q12888 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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TP53BP1Q12888 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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