Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC34P49427 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC34P49427 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC34P49427 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms