Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCKARP32238 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKARP32238 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKARP32238 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms