Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ApcsP12246 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ApcsP12246 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms