Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX4O95219 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX4O95219 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX4O95219 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms