Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRY3O43610 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms