Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP290O15078 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP290O15078 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP290O15078 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP290O15078 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP290O15078 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP290O15078 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP290O15078 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP290O15078 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP290O15078 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP290O15078 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP290O15078 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP290O15078 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP290O15078 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP290O15078 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP290O15078 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP290O15078 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP290O15078 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP290O15078 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP290O15078 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP290O15078 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP290O15078 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP290O15078 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP290O15078 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP290O15078 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP290O15078 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP290O15078 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP290O15078 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP290O15078 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP290O15078 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP290O15078 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP290O15078 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP290O15078 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP290O15078 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP290O15078 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP290O15078 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP290O15078 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP290O15078 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP290O15078 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP290O15078 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP290O15078 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP290O15078 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP290O15078 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP290O15078 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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