Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIEO00221 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms