Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.57■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.56■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.55■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.54■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.53■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.53■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms