Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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