Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms