Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms