Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 DNAI1-201ENST00000242317 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 SNORA10-201ENST00000384084 133 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC092802.3-201ENST00000434207 420 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC092570.2-201ENST00000452117 1143 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC092687.2-201ENST00000452909 568 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 TNR-IT1-201ENST00000455447 630 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AL590326.1-201ENST00000460857 334 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC113352.1-201ENST00000513196 666 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC011726.3-201ENST00000518031 568 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AL355076.3-201ENST00000555838 587 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 LINC02318-202ENST00000556346 715 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 MIR4642-201ENST00000583943 82 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AL109918.2-201ENST00000605188 279 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AL136985.2-201ENST00000607372 535 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.99-201ENST00000621370 254 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 REG1CP-205ENST00000444841 1710 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 LINC02408-201ENST00000400306 1766 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1257-205ENST00000515659 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 CREM-214ENST00000395887 849 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CSPP1Q1MSJ5 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms