Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms