Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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