Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TMPOP42166 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TMPOP42166 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TMPOP42166 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TMPOP42166 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TMPOP42166 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
TMPOP42166 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
TMPOP42166 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
TMPOP42166 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
TMPOP42166 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
TMPOP42166 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TMPOP42166 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TMPOP42166 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMPOP42166 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TMPOP42166 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms