Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD13P35453 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD13P35453 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD13P35453 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD13P35453 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD13P35453 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD13P35453 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD13P35453 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD13P35453 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD13P35453 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD13P35453 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD13P35453 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD13P35453 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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HOXD13P35453 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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HOXD13P35453 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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HOXD13P35453 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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HOXD13P35453 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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HOXD13P35453 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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HOXD13P35453 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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HOXD13P35453 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD13P35453 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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