Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms