Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 TOMM7-202ENST00000372879 514 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL355490.2-201ENST00000422848 548 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HMGB1P1B2RPK0 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HMGB1P1B2RPK0 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HMGB1P1B2RPK0 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HMGB1P1B2RPK0 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HMGB1P1B2RPK0 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HMGB1P1B2RPK0 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
HMGB1P1B2RPK0 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HMGB1P1B2RPK0 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HMGB1P1B2RPK0 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
HMGB1P1B2RPK0 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms