Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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USP18Q9UMW8 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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USP18Q9UMW8 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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USP18Q9UMW8 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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USP18Q9UMW8 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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USP18Q9UMW8 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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USP18Q9UMW8 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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USP18Q9UMW8 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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USP18Q9UMW8 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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