Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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