Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms