Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
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