Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms