Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NTRK2Q16620 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms