Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms