Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC100832.2-201ENST00000582080 776 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 IGKV6D-41-201ENST00000390271 371 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINC01961-201ENST00000449954 745 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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