Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms