Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
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