Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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ITGB3BPQ13352 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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ITGB3BPQ13352 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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ITGB3BPQ13352 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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ITGB3BPQ13352 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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ITGB3BPQ13352 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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ITGB3BPQ13352 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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