Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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IFT88Q13099 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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IFT88Q13099 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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IFT88Q13099 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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IFT88Q13099 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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