Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms