Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NMBRP28336 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NMBRP28336 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NMBRP28336 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NMBRP28336 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NMBRP28336 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NMBRP28336 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NMBRP28336 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NMBRP28336 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NMBRP28336 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NMBRP28336 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NMBRP28336 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NMBRP28336 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NMBRP28336 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms