Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 BCRP8-201ENST00000412037 255 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC093580.1-201ENST00000420549 671 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC074286.1-202ENST00000441205 567 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 RN7SL869P-201ENST00000497032 300 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 ROPN1B-207ENST00000511082 782 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC093074.1-201ENST00000590280 556 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC073389.2-201ENST00000606726 571 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC233702.2-201ENST00000618784 583 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC005383.1-201ENST00000622689 534 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SCG3Q8WXD2 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 LINC02408-201ENST00000400306 1766 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 FCGR2A-202ENST00000367972 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SCG3Q8WXD2 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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