Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL390866.1-201ENST00000425137 469 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RPL6P24-201ENST00000445338 864 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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