Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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RAB6CQ53S08 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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RAB6CQ53S08 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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RAB6CQ53S08 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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RAB6CQ53S08 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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RAB6CQ53S08 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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RAB6CQ53S08 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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RAB6CQ53S08 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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