Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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BBS9Q3SYG4 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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BBS9Q3SYG4 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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BBS9Q3SYG4 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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BBS9Q3SYG4 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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BBS9Q3SYG4 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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BBS9Q3SYG4 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BBS9Q3SYG4 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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