Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.8 ms