Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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BRD3Q15059 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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BRD3Q15059 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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BRD3Q15059 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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