Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MIR6732-201ENST00000619365 60 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ZCWPW2-201ENST00000383768 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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