Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CCDC196-207ENST00000636229 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 NDUFB4-201ENST00000184266 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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TOP3AQ13472 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC104117.5-201ENST00000606195 547 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
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