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| FOXE3 | Q13461 | AC091982.1-202 | ENST00000473923 | 343 nt | BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.51 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | CT45A7-201 | ENST00000610598 | 996 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.51 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC002115.2-201 | ENST00000640449 | 603 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL356585.10-201 | ENST00000641883 | 123 nt | BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | EPG5-201 | ENST00000282041 | 12633 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RAI14-208 | ENST00000506376 | 3091 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ARHGAP29-201 | ENST00000260526 | 6087 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | DCLK1-208 | ENST00000615680 | 7592 nt | TSL 2 BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TCF7L2-218 | ENST00000538897 | 4000 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ATXN3-204 | ENST00000429774 | 6713 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | COPS4-209 | ENST00000511653 | 1695 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | BCO2-214 | ENST00000532593 | 1647 nt | TSL 2 BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | VPS39-202 | ENST00000348544 | 2661 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | DEFB132-201 | ENST00000382376 | 2121 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PIK3CB-208 | ENST00000477593 | 4658 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CHD2-208 | ENST00000626874 | 7764 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RASSF9-201 | ENST00000361228 | 5682 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.59 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF33B-201 | ENST00000359467 | 5958 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 5.58 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CNOT6LP1-201 | ENST00000559681 | 1462 nt | BASIC | 5.58 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC007359.1-202 | ENST00000419158 | 2939 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.58 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FAM221B-203 | ENST00000423537 | 2931 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 5.58 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC008175.1-201 | ENST00000446299 | 2939 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.58 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SORBS1-205 | ENST00000371227 | 7279 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.58 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TPD52-203 | ENST00000448733 | 4339 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.58 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RNGTT-203 | ENST00000538899 | 1374 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.58 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC092725.2-201 | ENST00000567658 | 1389 nt | BASIC | 5.58 | □□□□□ -1.52 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | TTC26-203 | ENST00000464848 | 4299 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.58 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SMR3B-201 | ENST00000304915 | 785 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.58 | □□□□□ -1.52 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HEPACAM2-201 | ENST00000341723 | 2122 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.58 | □□□□□ -1.52 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AL353633.1-201 | ENST00000458480 | 382 nt | TSL 3 BASIC | 5.58 | □□□□□ -1.52 | | |