Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
TCOF1Q13428 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms