Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IFT88Q13099 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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