Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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GPS1Q13098 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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GPS1Q13098 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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GPS1Q13098 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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GPS1Q13098 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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GPS1Q13098 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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GPS1Q13098 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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GPS1Q13098 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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