Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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