Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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